Atos remporte un contrat de 20M€ pour l’extension d’un HPC au Brésil [Brève-blog]

Le supercalculateur Santos Dumont (SDumont), acquis en 2014 auprès de la société ATOS/BULL, est situé au siège du Laboratoire National de Calcul Scientifique (LNCC), à Petrópolis-RJ, agissant comme nœud central ( Tier-0 ) du National Système de traitement haute performance – SINAPAD.

SDumont dispose d’une capacité de traitement installée d’environ 5,1 Petaflop/s (5,1 x 10 ¹⁵ opérations en virgule flottante par seconde ), présentant une configuration hybride de nœuds de calcul, au regard de l’architecture de traitement parallèle disponible.

SDumont dispose d’un total de 36 472 cœurs de processeur, répartis sur 1 134 nœuds de calcul, dont la majorité est composée exclusivement de processeurs à architecture multicœur. Il existe cependant un nombre supplémentaire important de nœuds qui, en plus des mêmes processeurs multicœurs, contiennent des types de périphériques dotés de l’architecture dite multicœur : GPU et MIC. SDumont est équipé d’un nœud différent, MESCA2, avec un nombre élevé de cœurs (240) et une architecture de mémoire partagée de grande capacité (6 To dans un seul espace d’adressage). De plus, il existe un nœud spécialement conçu pour les applications d’intelligence artificielle (Deep Learning) doté de 8 GPU NVIDIA Tesla V100-16Gb avec Nvlink, totalisant 40 960 CUDA-core et 5120 Tensor-core.

La configuration détaillée est présentée en fin d’article.

Après 10 ans de bons et loyaux services, un petit nettoyage de printemps s’imposait.

Atos a annoncé le 11 avril avoir remporté un contrat de 19.5M€ pour étendre la capacité du HPC en multipliant par 4 sa vitesse de calcul un peu dépassée car en pétaflops.

Il y a eu depuis les téraflops et maintenant les exaflops.

Le SDumont modernisé sera basée sur l’architecture BullSequana XH3000,confirmant ainsi la position du supercalculateur comme le plus puissant d’Amérique latine dédié à la recherche universitaire.

Le LNCC cherchait à moderniser Santos Dumont, non seulement pour répondre à la demande croissante de la communauté universitaire en matière de calcul, mais aussi pour l’accompagner dans ses initiatives de recherche de pointe, en particulier dans le secteur pétrolier et gazier. Installé à Petrópolis, Rio de Janeiro, et avec une capacité étendue de 17 pétaflops additionnels, le supercalculateur fonctionnera désormais avec une capacité de traitement totale d’environ 18,85 quadrillions d’opérations par seconde, soit une augmentation d’environ 575 % par rapport à sa capacité initiale de 1,1 pétaflops en 2015.

« Nous sommes ravis de renforcer notre partenariat de longue date avec le LNCC et d’améliorer encore les capacités du supercalculateur Santos Dumont. Ce contrat témoigne de l’engagement d’Eviden à soutenir la recherche universitaire et les initiatives de pointe en la matière au Brésil. Grâce à notre architecture BullSequana XH3000, le LNCC aura accès à la puissance de calcul disponible la plus avancée qui soit, ce qui permettra de réaffirmer la position de Santos Dumont en tant que premier supercalculateur d’Amérique latine », a déclaré Luis Casuscelli, Directeur Big Data & Cybersécurité d’Eviden en Amérique du Sud, Groupe Atos. 

Fábio Borges, directeur du Laboratoire national de calcul scientifique (LNCC) a déclaré : « Grâce à Petrobras, nous disposons des ressources nécessaires pour soutenir de manière significative des projets de recherche et de développement de pointe, qui font progresser la science et la technologie dans le monde entier. Grâce à Eviden, nous avons désormais accès à un superordinateur de pointe qui permet aux chercheurs brésiliens de mener des expériences et des simulations scientifiques à grande échelle, ce qui accroît nos capacités dans divers domaines d’étude et favorise les découvertes et les innovations révolutionnaires ».

Au total, environ 434 projets ont été menés avec Santos Dumont dans des domaines stratégiques tels que l’exploration pétrolière et gazière, le charbon et les énergies renouvelables. Celui-ci a également été mobilisé sur d’autres activités, tels que le développement de médicaments et de vaccins contre la COVID-19, le développement de médicaments contre le VIH et la conduite d’études climatiques.

Eviden apportera 5 racks BullSequana XH3000 afin de garantir des performances exceptionnelles, combinant efficacité énergétique et refroidissement avancé grâce à sa technologie brevetée Direct Liquid Cooling (DLC). L’objectif ? Fiabilité, durabilité et coût de fonctionnement réduit. La capacité de Santos Dumont sera renforcée par 60 CPU, 62 GPU (2 x Intel Sapphire Rapids et 4 x Nvidia Hopper HGX H100) et 36 GPU Grace Hopper avec stockage DDN. Eviden fournira par ailleurs sa suite logicielle, comprenant Smart Management Center, Smart Performance Management Suite, Smart Energy Management Suite et Smart Data Management Suite.

Tout cela nous permet de voir clairement que les HPC c’est avant tout et surtout une activité à 99.99% souveraine et qu’il n’y a AUCUNS AUTRES CONTRATS QUE CEUX DE LA DGA dans la division Supercalculateurs !!!!!!!!!!!

Configuration du SDumont avant extension

• 504 nœuds de calcul B710 ( nœud mince ), où chaque nœud dispose de 2 processeurs Intel Xeon E5-2695v2 Ivy Bridge (12c à 2,4 GHz) et de 64 Go de mémoire RAM

• 198 nœuds de calcul B715 ( nœud fin ) avec GPU K40, où chaque nœud dispose de 2 processeurs Intel Xeon E5-2695v2 Ivy Bridge (12c à 2,4 GHz) et de 64 Go de mémoire RAM

• 54 nœuds de calcul B715 ( nœud mince ) avec XEON PHI, où chaque nœud dispose de 2 processeurs Intel Xeon E5-2695v2 Ivy Bridge (12c à 2,4 GHz) et de 64 Go de mémoire RAM

• 1 nœud de calcul MESCA 2 avec mémoire partagée, 16 processeurs Intel Xeon Ivy Bridge (15c à 2,4 GHz) et 6 To de RAM

• 246 nœuds de calcul (CPU), chacun avec 2x Intel Xeon Cascade Lake Gold 6252 et 384 Go de RAM

• 36 nœuds de calcul (CPU), chacun avec 2x Intel Xeon Cascade Lake Gold 6252 et 768 Go de RAM

• 94 nœuds de calcul (GPU), chacun avec 2x Intel Xeon Cascade Lake Gold 6252, 4x GPU NVIDIA Volta V100 et 384 Go de RAM

• 1 nœud pour l’intelligence artificielle avec 2x Intel Xeon Skylake Gold 6148 (20c à 2,4 GHz), 8x NVIDIA Tesla V100-16 Go avec NVLink et 384 Go de RAM

Les 1134 nœuds SDumont sont interconnectés par un réseau d’interconnexion Infiniband offrant des performances élevées et une faible latence tant pour la communication entre les processus que pour l’accès au système de fichiers.

Enfin, SDumont dispose d’un système de fichiers parallèle Lustre, intégré au réseau Infiniband, d’une capacité brute de stockage d’environ 1,7 Po, ainsi que d’un système de fichiers secondaire d’une capacité brute de 640 To.